হবিগঞ্জ শহরের দীর্ঘদিনের সমস্যা জলাবদ্ধতা। প্রতি বছর বর্ষা মৌসুমে জলাবদ্ধতায় ভোগান্তি আর আর্থিক ক্ষতির শিকার হতে হয় শহরবাসীকে। ইতিমধ্যে শহরের বাইপাস সড়কসহ বিভিন্ন এলাকায় মোহনপুর, চিড়াকান্দি, মুসলিম কোয়ার্টার, পুরান মুন্সেফি, শ্যামলীসহ বেশ কিছু এলাকার ছোট ড্রেনগুলো ময়লা-আবর্জনায় ভরে গেছে। এ কারণে ভারি বর্ষণ হলে জলাবদ্ধতার শঙ্কা বাসিন্দাদের। যদিও চলতি বছর জলাবদ্ধতা নিরসনে শহরের  বাইপাস সড়কসহ কয়েকটি এলাকায় পানি নিষ্কাশনে ড্রেন সংস্কারে কাজ করছে হবিগঞ্জ পৌরসভা। 
স্থানীয়রা জানান, প্রতি বছর বর্ষা মৌসুমে জলাবদ্ধতার কবলে পড়েন হবিগঞ্জ শহরবাসী। কয়েক ঘণ্টার টানা বর্ষণে ডুবে যায়, শহরের প্রধান সড়কসহ সবগুলো পাড়া মহল্লার রাস্তা। বাসা-বাড়িতে পানি ওঠে নষ্ট হয়ে যায় গুরুত্বপূর্ণ মালামাল। ব্যাপক ক্ষতির মুখে পড়েন শহরবাসী। ঘটনার পুনরাবৃত্তি এড়াতে চলতি বছর হবিগঞ্জ পৌরসভা কর্তৃক খাল খনন, ড্রেন নির্মানের দাবী সচেতন মহলের। স্থানীয়রা বলেন, ‘খালগুলোকে দখলমুক্ত করে খননের আওতায় আনতে হবে। তাহলেই জলাবদ্ধতা অনেকাংশে নিরসন হবে’।
হবিগঞ্জ পৌর নির্বাহী কর্মকর্তা মোঃ জাবেদ ইকবাল চৌধুরী বলেন, জলাবদ্ধতা নিরসনে কাজ করছে পৌরসভা। ইতিমধ্যে নতুন প্রজেক্টের আওতায় শহরের বাইপাস সড়কসহ কয়েকটি ড্র্রেন মেরামতের চলছে। মূূূলত, পৌরসভার ফান্ডের উপর ভিত্তি কাজ করা হয়। আমরা চেষ্টা করছি, কিভাবে কাজ করা যায়।